La historia de este museo está marcada por la presencia de la escultura del Señor de la Vera Cruz, patrono de la ciudad de Potosí. El lugar no solo alberga una gran pinacoteca en los corredores de su claustro franciscano, sino también los cementerios conventuales, conocidos como criptas, que se ubican en el subsuelo de la iglesia. Además, cuenta con el fascinante mirador de Santa María de los Ángeles, convirtiéndolo en un sitio histórico y religioso único en Bolivia.